Tá go leor cineálacha peptídí transmembrane ann, agus tá a n-aicmiú bunaithe ar airíonna fisiceacha agus ceimiceacha, foinsí, meicníochtaí ionghabhála, agus feidhmeanna bithleighis.De réir a n-airíonna fisiceacha agus ceimiceacha, is féidir peptides treáite membrane a roinnt ina thrí chineál: cationic, amphiphilic agus hydrophobic.Is ionann peiptídí treáite membrane cationic agus amphiphilic agus 85%, agus níl ach 15% i gceist le peiptídí treáite membrane hidreafóbach.
1. Peptíde penetrating membrane cationic
Tá peptides transmembrane cationic comhdhéanta de pheptídí gearr saibhir i arginine, lísín, agus histidine, mar shampla TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 agus DPV6.Ina measc, tá guanidine ag arginine, ar féidir leis hidrigin a nascadh le grúpaí aigéad fosfaracha a ghearrtar go diúltach ar an membrane cille agus peptides transmembrane a idirghabháil isteach sa scannán faoi choinníoll luach PH fiseolaíoch.Léirigh staidéir ar oligarginine (ó 3 R go 12 R) nár baineadh amach an cumas treá membrane ach amháin nuair a bhí an méid arginine chomh híseal agus 8, agus tháinig méadú ar chumas treá membrane de réir a chéile leis an méadú ar an méid arginine.Cé go bhfuil cationic cosúil le arginine ag lísín, níl guanidine ann, mar sin nuair a bhíonn sé ann ina n-aonar, níl a éifeachtúlacht treá membrane an-ard.Tá Futaki et al.(2001) nach bhféadfaí dea-éifeacht treá membrane a bhaint amach ach amháin nuair a bhí ar a laghad 8 aimínaigéad a bhfuil muirear dearfach acu sa pheptíd treáite membrane cationic.Cé go bhfuil iarmhair aimínaigéad luchtaithe go dearfach riachtanach le haghaidh peiptídí treáite chun an scannán a threá, tá aimínaigéid eile chomh tábhachtach céanna, mar nuair a shócmhainníonn W14 isteach i F, cailltear penetrability Penetratin.
Is aicme speisialta de pheptídí transmembrane cationic seichimh logánú núicléach (NLSs), atá comhdhéanta de peptídí gearr saibhir i arginine, lísín agus proline agus is féidir a iompar chuig an núicléas tríd an choimpléasc pore núicléach.Is féidir NLSanna a roinnt tuilleadh ina chlóscríobh aonair agus dúbailte, comhdhéanta de bhraisle amháin agus dhá bhraisle de aimínaigéid bhunúsacha, faoi seach.Mar shampla, is NLS clóscríobh amháin é PKKKRKV ón víreas simian 40(SV40), agus is NLS clóscríobh dúbailte é próitéin núicléach.Is é KRPAATKKAGQAKKKL an seicheamh gearr ar féidir ról a bheith aige i dtrasmembrane membrane.Toisc go bhfuil líon muirir níos lú ná 8 ag an gcuid is mó de na NLSanna, ní peptidí trasmembrane éifeachtacha iad NLSanna, ach is féidir leo a bheith ina pheiptídí trasmembrane éifeachtach nuair a bhíonn siad nasctha go comhfhiúsach le seichimh peiptíde hidreafóbach chun peiptídí trasmembrane amphiphilic a fhoirmiú.
2. Peptíde transmembrane amphiphilic
Is éard atá i peptídí transmembrane amphiphilic ná fearainn hidrofilic agus hidreafóbach, ar féidir iad a roinnt ina amfaphilic bunscoile, amfaphilic tánaisteach α-helical, β-folding amphiphilic agus prolin-saibhrithe amphiphilic.
Peptídí membrane caitheamh amfaphilic den chineál bunscoile ina dhá chatagóir, catagóir le NLSanna ceangailte go comhfhiúsach ag seicheamh peptide hidreafóbach, mar shampla MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) agus Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), Tá an dá cheann bunaithe ar an comhartha logánaithe núicléach PKKKRKV de SV40, Tá baint ag fearann MPG le seicheamh comhleá glycoprotein VEID 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A), agus tá baint ag fearann hidrofóbach Pep-1 leis an mbraisle saibhir tryptophan le ard-chleamhnas membrane (KETWWET WWTEW).Mar sin féin, tá baint ag fearainn hidreafóbach an dá cheann le comhartha logánaithe núicléach PKKKRKV trí WSQP.Rinneadh aicme eile de pheiptídí trasmembrane amfaphilic príomhúla a leithlisiú ó phróitéiní nádúrtha, mar pVEC, ARF(1-22) agus BPrPr(1-28).
Ceanglaíonn na peiptídí transmembrane amphiphilic α-helical tánaisteach leis an membrane trí α-helices, agus tá a gcuid iarmhair aimínaigéad hidreafail agus hidreafóbach suite ar dhromchlaí éagsúla an struchtúir helical, mar shampla MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).Maidir le membrane caitheamh amphiphilic cineál fillte béite peptide, tá a chumas bileog béite pleated ríthábhachtach dá chumas treá an scannáin, mar shampla i VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) sa phróiseas taighde a dhéanamh ar chumas treá an scannáin, ag baint úsáide as an gcineál D. - ní fhéadfadh analógacha sóchán aimínaigéad píosa fillte béite a fhoirmiú, tá cumas treá an scannáin an-lag.I peptídí transmembrane amphiphilic saibhrithe proline, tá polyproline II (PPII) déanta go héasca in uisce íon nuair a bhíonn proline saibhrithe go mór sa struchtúr polaipeiptíde.Is helix láimhe clé é PPII le 3.0 iarmhair aimínaigéad in aghaidh an cas, i gcomparáid leis an struchtúr caighdeánach alfa-helix ar dheis le 3.6 iarmhair aimínaigéad in aghaidh an cas.I measc na peptidí trasmembrane amfaphilic saibhrithe proline bhí peptide frithmhiocróbach buaibheach 7(Bac7), is féidir polaipeiptíde sintéiseach (PPR) n(n a bheith 3, 4, 5 agus 6), etc.
3. Peptíde treáite membrane hidreafóbach
Ní bhíonn ach iarmhair aimínaigéad neamhpholacha ag peptídí hidreafóbach, le glanmhuirear níos lú ná 20% de mhuirear iomlán an t-ord aimínaigéad, nó go bhfuil gnéithe hidreafóbach nó grúpaí ceimiceacha riachtanacha le haghaidh trasmembrane.Cé go ndéantar neamhaird de na peptidí trasmembrane ceallacha seo go minic, tá siad ann, mar fhachtóir fáis fibroblast (K-FGF) agus fachtóir fáis fibroblast 12 (F-GF12) ó sarcoma Kaposi.
Am poist: Mar-19-2023